Software zur Bestimmung von Peakpositionen

para · Moderator Anmeldungsdatum: 02.10.2004 Beiträge: 2874 Wohnort: Dresden

Ich suche eine Möglichkeit, aus einer Liste von Messwerten (Beispielgraph im Anhang) möglichst schnell und einfach die Lage der Peaks zu bestimmen. In dem Beispiel unten suche ich also 19 Positionen. Die Peaks kommen relativ gleichmäßig, und sind meist auch recht scharf. Aber sie haben nicht immer die selbe Höhe.
Am liebsten wäre mir, wenn als Ergebnis gleich eine Auflistung der Positionen bekommen würde.

Hat jemand einen Tipp mit welchem Programm ich das am besten bewerkstelligen könnte?

wishmoep · Anmeldungsdatum: 07.09.2008 Beiträge: 1342 Wohnort: Düren, NRW

In welcher Form liegen die Messwerte denn vor, bzw. wie sich diese berechnen. Man könnte sich ja eventuell selbst einen Algorithmus schreiben...

para · Moderator Anmeldungsdatum: 02.10.2004 Beiträge: 2874 Wohnort: Dresden

Die Werte liegen normal als x-y-Tabelle vor. Selber schreiben wäre sogar ziemlich unproblematisch, aber oft hatte bei solchen Sachen ja vorher schon mal jemand das Problem. ^^

mitschelll · Anmeldungsdatum: 06.12.2007 Beiträge: 362

Spontan würde ich sagen, dass es unmöglich ist die Peaks aus dem vollständigen Datensatz herauszufiltern.

Ich denke, Du müsstest Dir einen geeigneten Algorithmus überlegen, der die x-Achse in Stücke hackt, in denen die einzelnen Peaks liegen. Die Peaks scheinen ja nicht total unregelmäßig zu erscheinen. Aus diesen Abschnitten kannst Du dann jeweils das globale Maximum herauslesen.

dermarkus · Administrator Anmeldungsdatum: 12.01.2006 Beiträge: 14788

Es gibt fertige Algorithmen, die so etwas können, und sicher auch schon viele Programme, die so etwas integriert haben.

Ich finde solche Algorithmen unter Stichworten wie "peak search" oder "peak picking", siehe zum Beispiel

http://silvertone.princeton.edu/~park/thesis/dartmouth/html/ch2-1.html
http://www.kfs.oeaw.ac.at/stx/manual/html/1265.htm

Gemeinsame Ideen solcher Algorithmen sind:

Kandidaten für Peaks findet man leicht mit der Bedingung für ein relatives Maximum
Einfache Hilfsbedingungen sind zum Beispiel ein Schwellenwert, der überschritten sein muss, damit ein Kandidat als Peak zählen kann und nicht als Rauschen abgetan wird. Oder eine maximale Anzahl für die zu findenden Peaks (damit werden dann nur die n größten gefundenen genommen)
eine Interpolation, die hilft, Rausch-Zacken in der Kurve von echten Peaks zu unterscheiden. Zum Beispiel vielleicht einfach mal eine geglättete Kurve (Durchschnittsbildung mit ein paar Nachbarpunkten) aus den Daten erstellen lassen und dann prüfen lassen, ob an der Kandidatenstelle immer noch ein relatives Maximum ist.

Falls du nicht schon irgendwo so eine Funktion in Software findest, die du schon hast, dann könnte es sein, dass du auch schon mit fertiger Freeware komfortabel genug ans Ziel kommst. Vielleicht zum Beispiel mit Spinworks

http://www.uni-muenster.de/Chemie.oc/service/nmr/spinworks.htm

oder NMRview

http://openwetware.org/wiki/University_of_Chicago:NMR_Software_Guide#Volume_2:_A_User.E2.80.99s_Guide_to_NMRView
http://www.onemoonscientific.com/nmrview/

?

para · Moderator Anmeldungsdatum: 02.10.2004 Beiträge: 2874 Wohnort: Dresden

Danke für die ausführliche Antwort.