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[quote="Miki098"][b]Meine Frage:[/b] Hallo zusammen, ich würde gern die Entropie bestimmen von meinen Clustern die ich mit kmeans von meiner Protein-Trajektorie erhalten habe. Wenn ich die Entropie von einem Cluster habe, dann bekomme ich auch die gesamte und zwar über [latex]S = \sum S_i \cdot (N(i)/N)[/latex], wobei N(i) die Anzahl der Frames im Cluster i sind und N die Gesamtzahl. [b]Meine Ideen:[/b] Kann ich sagen, dass [latex]S_i = const -k_B \cdot [ln(\sigma)][/latex] mit [latex]\sigma[/latex] als die Varianz des Clusters. Ich kann annehmen, dass jeder Cluster normal-verteilt ist. Kann ich die Varianz ausrechnen, indem ich von jedem Atom die Varianz nehme und zusammen addiere?[/quote]
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Miki098
Verfasst am: 03. Mai 2021 11:11
Titel: Entropie von Cluster bestimmen?
Meine Frage:
Hallo zusammen,
ich würde gern die Entropie bestimmen von meinen Clustern die ich mit kmeans von meiner Protein-Trajektorie erhalten habe. Wenn ich die Entropie von einem Cluster habe, dann bekomme ich auch die gesamte und zwar über
,
wobei N(i) die Anzahl der Frames im Cluster i sind und N die Gesamtzahl.
Meine Ideen:
Kann ich sagen, dass
mit
als die Varianz des Clusters. Ich kann annehmen, dass jeder Cluster normal-verteilt ist. Kann ich die Varianz ausrechnen, indem ich von jedem Atom die Varianz nehme und zusammen addiere?